Les agents génétiques et épigénétiques sont couramment observés dans le CHC. Le système épigénétique a deux ailes : d'une part, les processus épigénétiques tels que la méthylation de l'ADN et la modification des histones ; d'autre part, les facteurs épigénétiques, qui sont de deux types : les facteurs internes tels que l'ARN non codant (ARNnc) et les facteurs externes tels que les aliments préventifs. Tous ces acteurs sont liés à la progression et à la métastase du CHC.