La grammaire et la syntaxe du génome et la composition du protéome des espèces streptocoques dans le microbiome humain sont le résultat d'un processus complexe d'optimisation entre les sélections, les mutations et les adaptations de ces micro-organismes dans des niches corporelles distinctes. Leurs relations phylogénétiques et leurs spécificités de niche agissent de concert et conduisent souvent à l'accrétion de nouvelles protéines et enzymes pour diversifier leurs besoins biochimiques.