Cette these s'inscrit dans le cadre de la modelisation des phenomenes naturels pour une instrumentation en un systeme de realite virtuelle. La these que nous defendons porte sur trois idees principales: 1. la modelisation traduit une praxis humaine. 2. les phenomenes sont modelises en tant qu'entites autonomes. 3. les interactions entre les entites passent par un milieu qui est cree et faconne par les entites elles-memes. Premierement, la modelisation est une activite humaine qui traduit implicitement et doit traduire explicitement une cause finale a la modelisation. Les phenomenes modelises sont les affordances d'un utilisateur du modele. Deuxiemement, l'autonomisation des modeles, consistant a donner au modele du phenomene naturel des capacites de perception, d'action et d'adaptation, est une solution pragmatique efficace pour la modelisation d'un systeme complexe. Troisiemement, en deleguant aux modeles la fabrication du milieu dont ils ont besoin pour determiner leurs interactions, nous pouvons simuler dans un meme environnement virtuel des modeles lies a des echelles tres differentes les unes des autres, tout en respectant, par exemple, les lois de conservations en physique."