La capacité endocrânienne est largement utilisée comme un indicateur de la taille réelle du cerveau, l'une des variables les plus importantes dans l'étude de l'évolution humaine. Elle est donc étudiée dans les restes fossiles afin de tirer des conclusions sur la taille du cerveau des premiers hommes. La capacité endocrânienne est un paramètre important dans l'étude des différences raciales et dans la pratique clinique pour l'étude des anomalies de la taille du crâne (indirectement la taille du cerveau). Sur le plan médical, l'analyse de la capacité crânienne révèle un autre aspect de la croissance et du développement et permet une évaluation critique des crânes anormalement grands, petits ou difformes. La capacité crânienne d'une femme est inférieure d'environ 11 % à celle d'un homme, et peut donc être utilisée comme paramètre pour la détermination du sexe. Elle peut être mise en corrélation avec d'autres paramètres crâniens et dans les études de la phylogénie des primates. Le foramen magnum est une grande ouverture à la base du crâne. Il est ovale, plus large en arrière et son plus grand diamètre est antéro-postérieur. Les dimensions du foramen magnum sont cliniquement importantes car les structures vitales qui le traversent peuvent subir une compression, comme dans les cas de hernie du foramen magnum, de méningiome du foramen magnum et d'achondroplasie du foramen magnum.