Chilis Welt steht Kopf! Ihr liebenswert-chaotischer Vater steckt wieder einmal bis zum Hals in Schwierigkeiten und ehemals gute Freunde verwandeln sich auf unerklärliche Art und Weise in fiese Tyrannen. Zum Glück gibt es die Stadtpiraten! Chili und ihr kleiner Bruder finden heraus, dass zwei Geheimbünde hinter den jüngsten Vorkommnissen stecken. Einer agiert von der Schule, der andere von einem Versteck in der Stadt aus. Chili, Pepper und Indigo begeben sich auf die Jagd durch die unterirdischen Kanäle der Stadt, denn kein Ort ist so verborgen, dass die Stadtpiraten ihn nicht finden können!