Ce travail de recherche s'inscrit dans le cadre des methodes factorielles qui permettent de decrire et predire des donnees structurees en plusieurs tableaux. Les objectifs et la nature des donnees d'epidemiologie analytique dans le domaine veterinaire ont amene a centrer le travail sur les methodes de regression multibloc, qui orientent la description de plusieurs tableaux de variables vers l'explication d'un autre tableau. Un des principaux objectifs est de contribuer a la reflexion sur la sensibilite de ces methodes a la multicolinearite. Des methodes statistiques existantes sont presentees et reliees dans un cadre unifie, relevant soit de criteres a maximiser comparables, soit d'un continuum general les reliant. De nouvelles methodes peu vulnerables a l'egard de la multicolinearite, et s'appliquant au cas de donnees structurees en deux puis en (K+1) tableaux, sont proposees. L'interet de ces methodes, ainsi que des continuums qui leur sont associes, est illustre sur la base d'etudes de cas reels en epidemiologie. Ce travail de recherche a permis d'appliquer les methodes multiblocs au domaine de l'epidemiologie animale, dans lequel elles n'avaient pas encore ete utilisees."