Dans une optique d'evaluation de l'etat phytosanitaire de la culture d'agrumes en Tunisie, un depistage des viroides infectant cette espece fruitiere dans un parc a bois de la profession a ete effectue. Des methodes de diagnostic, essentiellement moleculaires ont ete utilisees et developpees pour la detection de certains viroides infectant les agrumes. Sur le plan fondamental et pour caracteriser les isolats Tunisiens de ces pathogenes nous avons opte pour l'analyse de leur genome. Pour cela, nous avons synthetise de l'ADNc correspondant a plusieurs viroides infectant les agrumes et la vigne, par transcription reverse suivie par une amplification enzymatique (RT-PCR). L'ADNc obtenu a ete clone et sequence. Les viroides des agrumes etudies sont le CEVd, le HSVd et le CVd-III et pour la vigne les viroides etudies sont l'AGVd et le GYSVd-1. Ces pathogenes ont ete choisis pour l'interet agronomique et biologique qu'il presentent. Les viroides sequences ont ete egalement utilises dans cette etude pour etablir des relations taxonomiques avec les sequences de viroides decrits dans les banques de donnees, ce qui a permis leur classification."