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Didacticiel de Reconstruction D'Arbres Phylogenetiques: Le Marigot de Bignona

Autor Annick Chamontin
fr Limba Franceză Paperback – 30 noi 2011
L'environnement didactique ISee permet une initiation aux techniques et algorithmes de la bioinformatique, comme la recherche de regions codantes dans les genomes. Dans ce contexte, un nouveau module destine a expliquer les principes de la reconstruction algorithmique d'arbres phylogenetiques a ete concu et developpe en Java. Un arbre phylogenetique rend compte de l'emergence des especes au cours du temps et fait ainsi apparaitre leur relation de parente: deux especes sont d'autant plus proches qu'elles sont apparues a partir d'une espece ancestrale commune recente. Le nouveau module presente UPGMA, l'une des methodes de reconstruction d'arbres phylogenetiques a partir de sequences genomiques d'especes actuelles. Pour expliquer la methode de reconstruction, le module affiche la matrice des distances entre les especes, puis la construction de l'arbre, pas a pas, et ce de maniere interactive. Le module presente aussi les hypotheses de base sur lesquelles repose la methode de construction et en demontre les limites, a savoir l'hypothese de l'horloge moleculaire et l'hypothese que les sequences sont proches. Pour cela il offre trois interfaces, en libre exploration et experimentation."
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Specificații

ISBN-13: 9783841783035
ISBN-10: 3841783031
Pagini: 108
Dimensiuni: 152 x 229 x 7 mm
Greutate: 0.17 kg
Editura: Editions universitaires europeennes EUE