Chlamydophila pecorum est une espece bacterienne intracellulaire obligatoire de la famille Chlamydiaceae. Le criblage d'une banque genomique de C. pecorum en utilisant un serum ovin specifique a permis d'identifier la proteine de la membrane d'inclusion (IncA) comme un candidat potentiel pour le serodiagnostic de C. pecorum et de mettre en evidence une sequence repetee codante (CTR) riche en alanine et proline dans le gene incA de C. pecorum. Cette CTR presente des motifs d'acides amines differents suivant la pathogenicite des souches de C. pecorum. La variabilite genetique de 19 souches de C. pecorum isolees de ruminant a ete etudiee par MVLST (multi-virulence sequence typing). Les genes ompA qui code pour la proteine majeure de la membrane externe, incA et l'ORF663 (cadre ouvert de lecture) permettent de differencier les souches pathogenes de C. pecorum des souches non-pathogenes. Cette hypothese a ete confirmee sur 32 autres souches comprenant 11 souches isolees de porcs. Les souches de C. pecorum isolees de lesions sont genetiquement differentes des souches isolees d'animaux asymptomatiques. Les 3 genes ompA, incA et l'ORF663 sont des marqueurs moleculaire epidemiologiques."