Les leishmanioses sont des maladies parasitaires causées par des protozoaires du genre Leishmania. De multiples modifications écologiques et démographiques sont en cours en Amazonie. Afin de comprendre leur impact sur l'épidémiologie des leishmanioses, une vaste étude mettant en oeuvre des techniques de biologie moléculaire spécialement adaptées a été réalisée en Guyane de 2003 à 2006. L'estimation détaillée du taux d'incidence des leishmanioses cutanées a révélé un risque accru de transmission en lien avec l'extraction aurifère en forêt. Le polymorphisme des parasites issues de patients a été corrélé avec l'origine géographique et la présentation clinique de l'infection. L'étude des vecteurs et des mammifères réservoirs a démontré: (i) l'adaptation de certains phlébotomes aux milieux transformés par l'homme, (ii) l'absence d'implication des chauves-souris dans les cycles parasitaires et (iii) le risque d'importation de parasites responsables des formes viscérales de la maladie. Une intégration des données moléculaires, écologiques, épidémiologiques, cliniques, géographiques, démographiques et sociales est proposée.