L'infiltration-percolation est utilisee en traitement tertiaire dans le but de la recharge de la nappe ou de la reutilisation en agriculture. Notre travail avait pour objectif d'etudier les mecanismes hydrauliques et biogeochimiques mis en jeu dans le processus de traitement par le sol afin d'optimiser le monitoring des installations. Une etude hydrodynamique a ete realisee afin de determiner le nombre optimal de bachees a apporter par jour afin de maximiser l'aeration du systeme. Nous avons une elimination des MES par filtration superficielle, degradation de la matiere organique, oxydations des composes azotes sous forme de nitrates par les bacteries fixees qui se developpent au sein du massif. La biomasse microbienne augmente en fonction du temps d'alimentation et elle est localisee surtout entre 10 et 25 cm de la profondeur du massif, mais commence a disparaitre pendant la periode de repos. On a obtenu une correlation positive entre la biomasse mesuree par la methode de fumigation-extraction et dosage de l'ADN. Et pour illustrer la localisation du biofilm dans les fissures du garnissage utilise, nous avons utilise le MEB. "