Ce travail traite de la commande MPPT et optimisation d'un systeme photovoltaique pour un site isole. Ainsi, nous avons propose un algorithme par logique floue permettant la poursuite du point de puissance maximal afin de remedier aux inconvenients des methodes classiques. Ensuite, nous nous sommes interesses a l'optimisation de la structure de l'installation. En effet, dans les installations classiques, dans le cas de defaillance d'un panneaux, tout le bloc serie devient nutilisable, ce qui reduit considerablement les capacites de production de l'installation. Pour resoudre ce probleme, nous avons propose un superviseur permettant la reconfiguration automatique de l'installation de telle sorte que seul le panneaux defaillant est mis hors connexion. Par ailleurs, pour gerer le flux de puissance et pour repondre a la demande de l'utilisateur, nous avons developpe un superviseur par logique floue. Ainsi, le surplus de production est stocke systematiquement dans la batterie pour l'utiliser ensuite en cas ou la demande depasse la production. De plus, la structure proposee permet de ne solliciter la batterie en cas de besoin de ce qui permet de prolonger considerablement sa duree de vie."