Este estudio se centra en la caracterización físico-química y los parámetros de contaminación orgánica del agua, en seis humedales naturales de la vasta región del norte del Sahara: Lago Témacie, Lago Megarine y Oued Still, Oued Djedi, Lago Ayata, Oued Zemar (Biskra). Los estudios realizados entre octubre de 2016 y mayo de 2017, mostraron que la mayoría de los sitios son ligeramente turbios, salobres o salados con una conductividad de baja a alta dependiendo de la salinidad, y un pH alcalino medio. Las concentraciones de los iones estudiados (NH4+ y PO4-3) son altas en Oued Djedi y el lago Ayata en comparación con los otros sitios, y para el nitrito (NO2-) son muy altas en Oued Djedi que en los otros sitios. Los parámetros de contaminación orgánica varían de un lugar a otro. Los valores de SST (sólidos en suspensión) son más elevados para los hidrosistemas corrientes en comparación con los hidrosistemas estancados, los valores de DQO (demanda biológica de oxígeno) varían entre (32 mg/l) y (85 mg/l), lo que denota una contaminación orgánica importante a nivel del lago Megarine y de Oued Still y Oued Zemar (Biskra), mucho más sometidos a la acción antrópica.