I microrganismi associati agli ambienti termali marini sono generalmente descritti in quattro modi sulla base del loro habitat: quelli negli spazi dei pori e nelle fessure sotto le superfici; quelli sulla superficie esterna dei depositi di solfuro, tipicamente come tappeti; quelli su e all'interno degli invertebrati, spesso come simbionti e quelli all'interno del pennacchio di fluido idrotermale nell'acqua marina sovrastante. Uno studio ha coinvolto un ceppo di Bacillus moderatamente termofilo, che cresce a 55-65ºc. Allo stesso modo, 10 ceppi di pseudoalteromonas sp che riducono tellurite e selenite e che crescono a 40-50ºc. I microrganismi sono essenziali per la colonizzazione iniziale e richiedono un contatto fisico tra i batteri colonizzatori e tra questi e l'ospite. La mineralizzazione biologica è soggetta a due processi. Con un metodo, la mineralizzazione è orchestrata dall'organismo attraverso un processo "mediato dalla matrice organica". L'altro metodo è caratterizzato dalla formazione di minerali extracellulari/intercellulari in massa. Questo processo biologico dà luogo a prodotti cristallini simili a quelli attesi dalla cristallizzazione dalle soluzioni.