L¿adaptation des établissements publics de santé aux nouvelles exigences de la bonne gouvernance, d¿innovation, de qualité et de la performance, dans le contexte actuel de la mondialisation, dépend de la place qui y est accordée au système d¿information notamment comptable. Plusieurs constats ont mis en évidence la trop lente diffusion des outils modernes de gestion notamment la gestion comptable dans les organisations publiques malgré leurs avantages par rapport aux outils traditionnels. Dans ce travail de recherche, nous avons tenté d¿apporter de nouveaux éléments de réponse à ce paradoxe, en examinant deux volets de l¿introduction d¿une comptabilité d¿exercice (CE) au sein des centres hospitaliers universitaires au Maroc. Il s¿agit du choix d¿adoption d¿une CE qui examine les facteurs explicatifs de la décision d¿adoption de ce système comptable et les déterminants du succès global de sa mise en ¿uvre.