La gestion des cours d¿eau est un sujet d¿actualité. En effet, la réorganisation institutionnelle en cours (loi MAPTAM, compétence GEMAPI) tente de garantir une approche « intégrée » de la gestion des milieux aquatiques, avec en perspective l¿atteinte du bon état des eaux imposé par la Directive Cadre Européenne sur l¿eau. Le bon état des eaux superficielles est défini selon deux critères ; le bon état chimique et le bon état écologique. Ce dernier étant largement soutenu par la composante hydromorphologique, il est aujourd¿hui nécessaire de la prendre en considération pour la gestion des cours d¿eau. Cependant, au regard de la situation actuelle et de la situation envisagée par les réformes en cours, la place de l¿hydromorphologie dans la gestion des cours d¿eau est interrogée.