Depuis le début des années 90, on a assisté à la libération du secteur financier à l'instar d'autres secteurs de l'économie béninoise. Malgré le grand nombre de structures de micro finance qui ont vu le jour, les services financiers en direction de l'agriculture sont assurés seulement par un effectif réduitd'IMF. La présente recherche s'est fixée alors comme objectifs d'identifier les facteurs qui sont à l'origine du faible contribution des institutions de microfinance au financement du secteur agricole au Bénin. Ce diagnostic a permis de déboucher sur des propositions visant l'amélioration de la contribution des IMF au financement de l'Agriculture. Les résultats obtenus montrent que les stratégies de minimisations des risques mises en oeuvre par les IMF expliquent leur faible contribution au financement de l'agriculture. Par ailleurs, le caractère très sélectif des conditions d'accès aux services financiers des IMF est à l'origine du faible niveau de leur utilisation par les producteurs agricoles.Enfin,la non disponibilité de ressources financières à long terme au niveau des IMF conduit à une inadéquation des services qu'elles offrent par rapport aux besoins de financement