Les effets protecteurs des probiotiques sur diverses cellules et tissus ont été décrits. Par exemple, l'administration de doses adéquates de probiotiques protège le coeur des dommages, augmente le métabolisme, module la fonction du système immunitaire, augmente le taux de survie, améliore les performances de croissance, contribue à l'état de santé gastro-intestinal, prévient l'infection par des agents pathogènes in vitro et in vivo, réduit les dommages causés par les radicaux libres et empêche la progression des tumeurs.Différentes voies ont été suggérées concernant le mécanisme de ces organismes, comme la modulation de l'autophagie. Le rôle de l'autophagie est diversifié dans différents tissus et situations, la mort cellulaire dépendante de l'autophagie a été observée dans certaines cellules suite à une surcharge d'autophagie, d'autre part, il a été observé que l'altération de l'autophagie conduit à certaines maladies telles que les maladies inflammatoires de l'intestin (MII), la tuberculose, la neurodégénérescence et le vieillissement.Dans cet ouvrage, nous avons essayé de passer en revue le mécanisme d'autophagie des microbes probiotiques par lequel ils améliorent la santé en mettant l'accent sur les découvertes récentes dans le domaine.