L'oignon (Allium cepa), une liliacee tres appreciee par le consommateur marocain occupe une superficie de 30.600 ha qui est en constante progression depuis plusieurs annees. L'oignon comme dans la plupart des pays, constitue un legume populaire entrant dans la majorite des traditions culinaires. Dans la region de Meknes-El Hajeb, cette culture occupe une place importante parmi les autres cultures maraicheres aussi bien en superficie qu'en production. Dans ce travail nous avons identifiees par technique moleculaire, technique biochimique et le test de pathogenicite les agents pathogenes qui responsable a la pourriture molle des bulbes d'oignon. Par la technique de sequencage nous avons identifiees que la souche 2078-6 est une Pseudomonas marginalis et la souche 2079-5 est une citrobacter murliniae."