Fortschritte auf dem Gebiet der Biologie und der Einsatz von Hochdurchsatzmethoden fhren zu einem immer greren Datenaufkommen. Gleichzeitig sind eine Vielzahl von Werkzeugen fr die Analyse und Modellierung dieser Daten entwickelt worden. In diesem Zusammenhang kann eine Datenbank den Benutzer optimal untersttzen und bietet die Grundlage fr eine sinnvolle Organisation und Verwaltung der Daten. Die Entwicklung einer Datenbank fr den Einsatz in der metabolischen Stoffflussanalyse stellt einen hohen Anspruch an den konzeptionellen Entwurf. Es sollen unter anderem Informationen ber Molekle und Reaktionen gespeichert werden, die fr eine Modellierung von Bedeutung sind. Eine Besonderheit stellt die Speicherung von sogenannten Atom- Transitionen dar, welche fr die isotopenbasierte Stoffflussanalyse von entscheidender Bedeutung sind. Zur Datenprsentation und Datenbankabfrage kommt eine 4-Schichten-Architektur nach Standards der Java Enterprise Edition zum Einsatz. Diese Techniken bringen eine hohe Skalierbarkeit, Transaktionsschutz und eine vollkommene Systemunabhgigkeit mit sich.