En condiciones naturales, las plantas suelen estar rodeadas de una serie de enemigos potenciales. Éstas han creado estrategias de defensa contra patógenos y ataques de herbívoros, lo que ha permitido su perpetuación a lo largo de la evolución. Estos mecanismos de defensa están estrechamente asociados a la síntesis de metabolitos secundarios, que también son mundialmente utilizados en diversas áreas de la industria. Este libro aborda de forma sistemática cómo las plantas sintetizan estas sustancias en respuesta a estímulos bióticos o abióticos. A través de este libro revelamos que la síntesis de metabolitos secundarios de las plantas depende de cambios en varias rutas metabólicas, estando a menudo directamente asociadas con el metabolismo primario. En la actualidad, las herramientas genómicas han sido alternativas útiles que están conduciendo a una nueva revolución del fitomejoramiento, permitiendo la sobreexpresión o inhibición de estas sustancias. Se presentan algunas limitaciones y retos a alcanzar sobre la dinámica de síntesis de metabolitos secundarios en plantas.