Les avancees en Biologie Moleculaire ont accelere le developpement de techniques de genotypage haut-debit et ainsi permis le lancement des premieres etudes genetiques d'association a grande echelle. La dimension et la complexite des donnees issues de ce nouveau type d'etude posent aujourd'hui de nouvelles perspectives statistiques et informatiques necessaires a leur analyse, constituant le principal axe de recherche de cette these. L'ensemble des methodes decrites dans ce manuscrit ont ete implementees a travers trois logiciels disponibles: fueatest, LHiSA et kerfdr."