Devant l'interet croissant pour l'environnement et la conservation de la biodiversite, comprendre les principaux mecanismes des cycles biogeochimiques ayant lieu dans les ecosystemes coralliens et lagonaires est une priorite. Un modele 3D couple physique/biocheochimique a ete mis en place sur le lagon de Nouvelle-Caledonie: un 'hot spot' de biodiversite sous l'influence de divers forcages d'origines naturelles et anthropiques. L'impact d'un evenement extreme La Nina (2008) causant de fortes precipitations et ainsi d'importants apports dans le lagon a ete etudie. Les echanges complexes ocean-lagon ont egalement ete abordes via la modelisation de l'upwelling du Sud-Ouest engendre par les alizes. Le modele 3D couple 'on-line' a permis de montrer que la totalite du lagon etait impactee par les apports des rivieres et potentiellement ceux de l'ocean du large. Il s'est revele etre un outil robuste pour l'etude de ces environnements complexes et tres variables et peut ainsi representer un support a la gestion des zones cotieres ainsi qu'aux scientifiques pour la planification de campagne et l'analyse de donnees."