Nach dem Rückzug von P. Andreas Amrhein sollte die Beuroner Kongregation 1896 die Verhältnisse in St. Ottilien ordnen. Der damit beauftragte Abt Ildefons Schober fand bei seinem ersten Besuch, die »sogenannte Benediktiner Missions-Gesellschaft« sei »eine durchaus unfertige Sache. Die Missionsperson ist ein Zwitterding zwischen Säkulargeistlichem und Ordensmann.« In den nächsten Jahren musste man also nicht nur die missionarische Arbeit ausdehnen, sondern auch das Problem der inneren Ausrichtung lösen. Zügig gelang der Aufbruch in das Innere der Kolonie, in deren Norden ebenso wie in deren Süden. Seit 1896 entstanden die Stationen Tosamaganga und Madibira, 1897 wurde Peramiho gegründet. Gleichzeitig begann der Bau einer Kirche in St. Ottilien und einer alle kolonialen Dimensionen übersteigenden Kathedrale in Daressalaam. Der zum Apostolischen Präfekten ernannte P. Maurus Hartmann hoffte schon Ende 1896, das kommende Jahr würde »auch in der Mission allen Ruhe bringen«. Nach schweren Auseinandersetzungen besorgte 1902 ein Generalkapitel die »Inneneinrichtung« der Gemeinschaft. St. Ottilien wurde zur Abtei, das Missionsgebiet erhielt einen ersten Bischof.