La medicina alternativa è un gruppo di diversi sistemi medici e sanitari, pratiche e prodotti che non sono considerati parte della medicina convenzionale. Include Biofeedback, agopuntura, fitoterapia, massaggio, Reiki, terapia bioelettromagnetica, meditazione e musicoterapia sono esempi di trattamenti di medicina alternativa complementare. La medicina alternativa si concentra sul miglioramento non solo della salute orale dell'individuo, ma dell'individuo nel suo insieme, sia fisicamente che mentalmente. I pazienti preferiscono usare la medicina alternativa più delle medicine convenzionali a causa dei minori effetti collaterali che comporta. Molte lesioni della mucosa orale come la stomatite aftosa, il lichen planus, l'OSMF, la leucoplachia, la mucosite da radiazioni hanno dato grandi risultati di guarigione con l'uso di estratti di piante. I trattamenti di medicina alternativa includono vari tipi di metodi di guarigione naturale e spirituale. I trattamenti possono essere praticati individualmente così come in condizione con altri trattamenti convenzionali allo scopo di rilassare la mente, il corpo e l'anima. Le medicine alternative sono in pratica dai tempi antichi e sono praticate ancora oggi in tutto il mondo.