Pektinase war eines der ersten Enzyme, das seit 1930 in verschiedenen Sektoren kommerziell eingesetzt wurde. Auf mikrobielle Pektinasen entfallen 25 % aller weltweit verkauften Lebensmittelenzyme. Pektinasen sind derzeit die führenden Enzyme im kommerziellen Sektor. Es ist erwiesen, dass die Produktionskosten durch die Verwendung idealer Fermentationsbedingungen und preiswerter Rohstoffe als Kohlenstoffquelle und Substrat gesenkt werden können, anstatt Stämme mit hohem Ertrag einzusetzen.