L'objet de ce travail consiste en une analyse des activités scientifiques telles qu'elles s'organisent entre les milieux académique et industriel. La première partie, à travers un parallèle France/Etats- Unis, explique la mise en place du système dichotomique de production des connaissances scientifiques, instaurant une frontière opaque entre recherches publique et privée. Puis, au vu des évolutions connues par les environnements financier, juridique, technologique et économique, une caractérisation du système alternatif de coproduction des connaissances scientifiques qui s'est développé dès la fin du 20è siècle est opérée. La seconde partie se recentre sur les relations science industrie en France, à travers d'une part, une analyse des données bibliographiques des brevets demandés par le CNRS entre 1995 et 2005 et d'autre part, une illustration par la politique des Génopoles. L'objectif est alors de mettre en évidence les principales caractéristiques de la valorisation économiques des connaissances scientifiques menée en France et d'appréhender les moyens mis en œuvre pour s'adapter à ces évolutions ainsi que les obstacles qui persistent.