La biodiversité algale Tunisienne est énorme mais sous exploitée et non étudiée actuellement. En effet, une simple tentative de sélection et d¿isolement dans quelques biotopes tunisiens, nous a permis d¿identifier une vingtaine de souches de microalgues marines, présumées nouvelles. Trois souches ont montré des teneurs en lipides acceptable, et une bonne croissance. Ces trois souches microalgales ont été identifiées (Amphora subtropica, Amphora sp. et Navicula sp.). L¿étude a porté ensuite sur l¿optimisation des conditions de croissance de ces microalgues et les conditions d¿accumulation de lipides. Les trois diatomées étudiées sont des candidats potentiels pour la production de biodiesel de bonne qualité. Dans une troisième étape, un essai de développement et détermination du procédé de caractérisation, extraction et estérification des lipides est mis en place. Cette étude montre que les trois souches étudiées sont productrices potentielles de biodiesel par transestérification directe de la biomasse fraîche en présence de chloroforme. La dernière partie de ce travail a porté sur la valorisation des coproduits d¿extraction des lipides des microalgues.