En el presente trabajo se ha analizado la asociacion de islas CpG diferencialmente metiladas con multiples elementos genomicos. Para conseguir este objetivo se han desarrollado algoritmos de clustering, analisis estadisticos que determinen diferencias de metilacion en regiones predefinidas, analisis de enriquecimiento y analisis funcionales. Ademas, se presentan una serie de herramientas bioinformaticas que incluyen los controles de calidad necesarios para obtener mapas de metilacion de alta calidad a partir de experimentos de secuenciacion masiva con tratamiento con bisulfito."