Con el objetivo de reportar los indices espontaneos e inducidos y evaluar la eficiencia de diferentes biomodelos murinos en ensayos de genotoxicidad se compararon los indices espontaneos e inducidos con ciclofosfamida (CF) entre ratones de las lineas BALB/C, NMRI, OF-1 y C57BL6/cenp y ratas de las lineas Sprague Dawley (SD), Lewis y Wistar, todas comercializadas en Cuba. Se compararon segun los indicadores que se miden en los ensayos in vivo de genotoxicidad, mediante el ensayo cometa alcalino de leucocitos de sangre periferica, micronucleos y aberraciones cromosomicas de celulas de la medula osea y la morfologia de la cabeza del espermatozoide. Se reportaron los indices espontaneos e inducidos al ADN en especies murinas comercializadas en Cuba, siendo valores de referencia para este tipo de investigaciones nacionales e internacionales. Los resultados sugieren que la especie murina mas eficiente en las tecnicas evaluadas al comparar las diferentes especies son los ratones BALB/C con excepcion en el ensayo cometa donde la especie mas eficiente fueron las ratas SD experimentando los indices endogenos mas bajos y los inducidos mas altos a ciclofosfamida."