La rouille couronnee, causee par Puccinia coronata corda f.sp .avenae. Eriks, est la principale maladie fongique de l'avoine en Tunisie. Dans cette etude, quatre protocoles d'extraction d'ADN ont ete testes pour une utilisation ulterieure de l'ADN de qualite dans l'analyse RAPD. La methode - DTT - a donne la meilleur qualite et quantite de l'ADN. Vingt-et-une ont pu montrer une variabilite genetique entre les trois genotypes. Elles ont genere un total de 202 bandes, dont 65 sont polymorphes. Les produits d'amplifications varient de 200 a 900 pb de taille et de 4 a 15 en nombre. Les resultats ont montre que JT0 et JT5, ont un indice de similarite faible (0.53) compare a celui obtenu entre JT5 et Pc68 (0.57) et celui obtenu entre JT0 et Pc68. Le dendrogramme obtenu en utilisant la methode de Raup-Crik, a regroupe les genotypes en deux groupes. JT0 et Pc68 ont ete compiles dans le meme groupe avec un degre significatif de la similitude de 0.7, tandis que JT5 a ete isole seul avec un faible degre de similitude (0.09).L'accession JT0 pourrait heberger le gene de resistance Pc68, tandis que JT5 pourrait heberger un nouveau gene de resistance ou meme un nouveau controle genetique."