Les différentes classes de schéma d'hérédité des gènes plasmatiques et des allosomes par rapport au schéma d'hérédité autosomique mendélien discriminent le génome en une fraction, dont la règle principale est que la fitness de tous les gènes d'un ensemble est maximisée de la même manière. Chaque ensemble sera sélectionné s'il a la capacité de modifier le phénotype de l'organisme de manière à propager ou multiplier au maximum le gène. La coexistence de ces ensembles multiples dans le même génome crée un conflit connu sous le nom de conflit intra-génomique. La stérilité mâle cytoplasmique (CMS), qui est une caractéristique commune rencontrée chez les espèces végétales, est due à un conflit intragénomique. La relation entre le conflit intragénomique et la CMS, le type de conflit, le mécanisme moléculaire de la CMS et l'altruisme sont discutés dans le présent chapitre.