La presente investigaci n correspondi a un estudio observacional de tipo descriptivo y retrospectivo. El tama o muestral estuvo conformado por 7382 muestras de hisopado nasal que llegaron al laboratorio de Virolog a del INHMT durante el per odo de mayo a diciembre del a o 2009, de las cuales 2411 resultaron positivas para el Virus de Influenza A; stas fueron analizadas para los subtipos circulantes del virus mediante la t cnica de qRT-PCR y se obtuvo la identificaci n de los subtipos A H1N1 pdm (89,29 %), casos de Influenza A no subtipificables (8,08 %), H3 (2,28 %) y H1 estacional (0,33 %). El grupo etario m s afectado por el subtipo pand mico fue de 11 a 19 a os; el mayor n mero de casos del subtipo H1 estacional fue detectado en pacientes de 11 a 29 a os; los casos de Influenza A no subtipificables y los H3 se encontraron mayormente, entre ni os hasta los 5 a os de edad. La distribuci n de los subtipos identificados en el estudio no revel una diferencia significativa en relaci n al sexo; la mayor a de las muestras positivas para el subtipo A H1N1 pdm provinieron de la provincia de Pichincha, y el resto de subtipos, principalmente, de la provincia del Guayas.