Dans ce travail, nous analysons le concept de manipulation à travers une théorie élargie incluant le réalisme des entités et la théorie causale de la manipulation. Dans une seconde étape, nous effectuant une implémentation de cette théorie à différentes expériences scientifiques. Cette thèse est divisée en quatre parties : Dans la Partie I, nous parcourons une longue route afin d¿obtenir un concept aussi précis que possible de la manipulation. Nous analysons le réalisme structurel et nous identifions ses difficultés et ses limites concernant les problèmes ontologiques de la physique des particules. Sur cette base, il sera remplacé par le réalisme des entités. La Partie II est consacrée au réalisme des entités et notamment à ses fondements et ses arguments. Dans la Partie III, nous avons élaboré une théorie générale la manipulation/intervention qui est basée sur le réalisme des entités et la théorie de Woodward sur l¿intervention Dans la Partie IV, nous appliquons avec succès notre théorie générale à cinq (05) expériences de physique et d¿astrophysique.