Diagnosticar y tratar con precisión los TTM puede ser una tarea difícil y confusa. Muchos pacientes presentan síntomas asociados a más de un trastorno y estas relaciones pueden dificultar mucho el diagnóstico y las decisiones de tratamiento. Esto suele ocurrir principalmente porque los síntomas de los pacientes no siempre encajan en una sola clasificación. En muchos casos varias clasificaciones parecen apropiadas porque en realidad el paciente padece más de un trastorno. En muchos pacientes, un trastorno contribuye a otro. La interrelación de los distintos TMD siempre debe tenerse en cuenta en la evaluación y el tratamiento de los pacientes.