Ce travail implique une recherche fondamentale et appliquée sur les deux noyaux du thiophène et du pyrrole, l'objectif étant de prédire la réactivité chimique et l'activité biologique et d'établir un modèle pharmacophore pour de nouvelles molécules bioactives.Les méthodes de chimie computationnelle utilisées dans notre travail sont : les méthodes quantiques, les méthodes empiriques. Ces méthodes ont été utilisées pour déterminer les paramètres structuraux, électroniques et énergétiques associés aux molécules étudiées. Cette étude montre des résultats similaires entre ces différentes méthodes de calcul. La nature de tel substituant (donneur, accepteur) affecte les paramètres électroniques et énergétiques des thiophènes et des pyrroles. Une étude structure-propriétés-activité a été réalisée pour deux séries de dérivés bioactifs de thiophènes et de pyrroles. La nature des groupes sur l'anneau hétérocyclique des molécules étudiées affecte leurs propriétés physico-chimiques et, par conséquent, leurs propriétés pharmacologiques.