La science de la logique contient deux insuffisances internes. D'abord la catégorie de la différence tombe en dehors d'elle-même, faute d'être retournée sur elle-même : quelle est la différence essentielle de la différence inessentielle ? Ensuite, la catégorie de la quantité, qui procède de l'indifférence à tout contenu, doit alors elle aussi être retournée et comprise face à son autre. Les sciences quantitatives procèdent de l'indifférence à la nécessité de l'altérité face à laquelle toute chose se détermine logiquement, selon Hegel. Par conséquent la discipline qui étudie la nécessité des choses comme faisant face à leur autre est nécessairement elle-même l'autre des sciences. Cette discipline est la philosophie. La philosophie est donc l'autre essentiel et réciproque des sciences. A partir de là s'ouvre alors le champ d'une épistémologie nouvelle, une épistémologie dialectique et spéculative qui permet de rendre raison des problèmes de la physique contemporaine et sa difficulté croissante de produire des systèmes fondamentaux pouvant faire l'objet d'une expérimentation.