El microbioma oral es una parte importante del microbioma humano. La cavidad bucal tiene la segunda microbiota más grande después de los intestinos, y su estructura abierta crea un entorno especial. Con el desarrollo de tecnologías como la secuenciación de nueva generación y la bioinformática, se han hecho posibles amplios estudios en profundidad del microbioma. También pueden aplicarse en el ámbito clínico en términos de diagnóstico y tratamiento. Se han realizado muchos estudios del microbioma en enfermedades orales y sistémicas, que muestran una estrecha asociación entre ambas. Se espera que la comprensión del microbioma oral y la interacción con el huésped proporcione futuras direcciones para explorar los cambios funcionales y metabólicos en las enfermedades, y para descubrir los mecanismos moleculares para el desarrollo de fármacos y tratamientos que faciliten la medicina personalizada.